上海海港足球俱乐部成立于2005年12月25日，当时名为上海东亚足球俱乐部。 由上海东亚（集团）有限公司和上海根宝足球俱乐部基地有限公司共同出资组建，俱乐部于2012年底获得上港集团冠名上海有几个足球俱乐部，自2013年起参加各类赛事。以上海上港集团名义举办的赛事。 2014年11月18日，上港完成对上海东亚足球俱乐部的整体收购，俱乐部更名为上海上港足球俱乐部。 2021年1月13日，俱乐部正式更名为上海海港足球俱乐部，队名变更为上海海港队。
2006年，球队首次参加职业联赛。 2007年，他们获得中乙联赛冠军并成功升入甲级联赛。 2009年代表上海队参加全运会男子足球A组比赛并获得冠军。 2012年，以中甲冠军身份升入中超。 2013年、2017年两次夺得全运会男足A组冠军。
2015年获得中超亚军上海有几个足球俱乐部上海有几个足球俱乐部，并首次获得亚冠资格。 2016年，他们首次晋级亚冠联赛八强。 2017年首次打入亚冠联赛半决赛。 2018年，他们夺得队史、上海足球史上第一个中超冠军。
